行政单位暂付款和留存款核算处理一般是采用暂时性账户的方法。暂时性账户是指经费使用者向支付机构支付费用时，由支付机构暂时保存并冻结部分经费的一种账户。在一定的时间内，费用使用者可以根据费用使用情况向支付机构提交回报支付凭证，由支付机构审核并办理报销，并由支付机构及时解除冻结付款。
行政单位暂付款和留存款的核算处理，主要就是由支付机构建立暂收款账户和留存款账户，具体步骤如下：
1、费用使用者提交支付经办申请，由支付机构审核，建立暂收款账户，并冻结支付金额；
2、费用使用者在经办申请处领取费用，向支付机构提供支付凭证；
3、支付机构建立费用留存款账户，向费用使用者出具留存款凭证；
4、费用使用者提交报销凭证，由支付机构审核；
5、支付机构报销费用，解除冻结付款，并及时解除费用留存款账户；
拓展知识：行政单位暂收款和留存款的核算处理，实际也是一种结算方式，但是与普通的结算不同，它不仅需要从费用使用者收取费用，还需要从支付机构处进行报销，这就要求支付机构要有足够的内部控制，以确保资金使用的合理性和安全性。
